Inscription Administrative

Inscription ou réinscription OSU Institut Pythéas

Inscription Administrative (IA) pour les Masters de l’OSU Institut Pythéas - Master SET & Océanographie Mis à jour le mardi (...)

UE du Master 2 BEM

L’entrée en M2 est soumise à une sélection se basant sur les résultats universitaires en tenant compte de la difficultés des unités suivis au M1, sur la motivation du candidat et sur son attitude. Environ 25 étudiants sont sélectionnés chaque année. Les candidats au M2 de cette spécialité sont encouragés à postuler à différents Master.

Les unités du M2 spécialité BEM

Tous les enseignements sont optionnels. A l’issue d’entretiens pédagogiques individuels qui se déroulent le jour de la rentrée, les unités suivies par chaque étudiant sont définies. Les parcours ont pour but d’aider les étudiants dans leur choix d’UE, cependant, toutes les UE optionnelles sont optionnelles et sont accessibles aux étudiants . La somme des UE choisies doit correspondre à 30 crédits ECTS

Enseignements du M2 de la spécialité BEM du master d’Ocanographie
Libellé de l’UECrédits ECTSCoursTDTPEnseignants
EMM : Écologie microbienne marine avancée 6 30 6 14 Michotey V
Militon C
Cuny P
+ chercheurs MIO
ACLAP : Apprentissage classification et prévision 3 20 10 Nerini D
AERME1 : Approche Écosystème ressource Marine exploitée I 3 20 10 Chercheurs IRD sète
AERME2 : Approche Écosystème ressource Marine exploitée II 3 20 10 Chercheurs IRD sète
PROT 1 : Protection restauration Gestion Durable 1 3 20 10 Banaru D
Aurelle D
PROT 2 : Protection restauration Gestion Durable 2 3 20 10 Banaru D
Aurelle D
CONT : Hydrocarbures et contaminants organiques : devenir et impact 6 36 16 8 Cuny P
Militon C
SDME : Système dynamique en écologie 3 20 10 Poggiale JC
Gauduchon M
SPAT : Statistique spatiale 3 18 12 Monesthiez P
EVACO : Évolution adaptation et co- évolution 6 30 20 Gauduchon M
MEE :Macroévolution et environnement 3,
UE non ouverte en 2014
15 7 8 Deniel E
Borchiellini C
GEB : Évolution des génomes, outils bio informatiques 6 24 10 16 Deniel E
Borchiellini C Militon C Michotey V, Bonin P, Chenuil A
ECOPAYS : Écologie des paysages 3 15 15 Cresson P
ECOTOX :Écotoxicologie 3 15 15 Thiery A
Auffan M
Issartel J
INV : Invasions Biologiques marines 3 20 10 Boudouresque CF
Stage de 4 mois minimum (pendant période mi janvier-15 juin) 30
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descriptif UE S3

Stages
les étudiants peuvent chercher un stage par eux même ou postuler sur des sujets de stages proposés par divers organismes et laboratoires à nos étudiants

Sujets proposés aux étudiants de M2 BEM année 2016/17 au 20 octobre
1. Variabilité inter-spécifique et intra-spécifique des cinétiques d’absorption des éléments nutritifs chez les diatomées du genre Pseudo-nitzschia
2. Electrostimulation de microorganismes extrêmophiles issus de sources hydrothermales : quel est son rôle dans le développement de la biodiversité hydrothermale ?
3. Bactéries sulfato-réductrices et piézophilie : mise au point des outils de génétique moléculaire et ingénierie métabolique
4. Détection et étude de virus géants par la mise en culture d’échantillons environnementaux anciens en présence d’amibes du genre Acanthamoeba moderne et anciennes.
5. Etude de la dégradation biotique de la matière organique terrestre rejetée par les fleuves en mer
6. Analyse moléculaire et cellulaire de la régénération postérieure (caudale) chez l’annélide marine Platynereis dumerilii
7. Etude de la pression de sélection associée aux brouteurs dans l’écosystème côtier de la rade de Brest.
8. Impact des échanges océan-lagon sur l’abondance, la biomasse et la structure en taille du zooplancton récifo-lagonaire (Lagon de Ouano, Nouvelle Calédonie).
9. Dynamique du pico-nanoplancton et production nette à l’échelle de l’heure par des approches automatisées et innovantes (cytométrie en flux, spectromètre, biologie moléculaire, minicosme)
10. L’élimination de l’azote dans l’Estuaire du Saint-Laurent (Québec)
11. Etudes de procédés bio-inspirés d’extraction de métaux dans des eaux contaminées
12. Impact de l’environnement sur les hippocampes mouchetés
13. Réintroduction d’hippocampes mouchetés dans la réserve marine du Larvotto
14. Analyses des éléments traces métalliques dans le plancton et les poissons planctonophages dans la rade de Marseille
15. Analyses des éléments traces métalliques dans le muscle des céphalopodes du Golfe du Lion
16. Bioamplification et spéciation du mercure (Hg) dans le réseau trophique pélagique du Golfe du Lion
17. Modélisation numérique de la structure et de la dynamique de communauté planctonique en zone côtière. Utilisation de données acquises en mésocosmes et application à la lagune de Thau.
18. Recherche, caractérisation et production de P(3HB-co-4HB) à partir de bactéries marines.
19. Caractérisation de la biodiversité des monts sous marins
20. Suivi temporel de la diversité des diazotrophes à la station SOMLIT Point B.
21. Réponse physiologique d’une cyanobactérie diazotrophe à la température
22. Étude de la diversité microbienne le long d’un gradient de température au site de Capélinhos (Lucky Strike, MAR) : focus sur le métabolisme du fer.
23. Relation entre l’état de santé des écosystèmes littoraux et la diversité fonctionnelle du phytoplancton
24. Approche participative pour la modélisation qualitative de socio-écosystèmes aquacoles
25. Exploring the roles of PCP components in a marine sponge, Oscarella lobularis (Porifera Homoscleromorpha)
26. Etude des efflorescences algales des lagons polynésiens en mésocosme et par meta-barcoding
27. Analyse automatisée à basse et haute fréquences des micro-organismes auto- et hétérotrophes (procaryotes) par cytométrie en flux : Application aux milieux naturels et à des échantillons issus de filières de production d’eau potable.
28. Application et adaptation d’un modèle bioénergétique de croissance et reproduction sur le modèle biologique Crassostrea gigas en Méditerranéenne (lagune de Thau)
29. Etude des communautés microbiennes de subsurface du Massif Atlantis, dorsale Médio-Atlantique
30. Recherche de biomarqueurs de santé chez le Platax orbicularis
31. Variations saisonnières de la concentration en mercure dans le muscle de deux espèces de rougets
32. Cycle du silicium dans l’Océan Arctique - Rôle des diatomées dans le bloom phytoplanctonique de printemps
33. projets de R&D dans le domaine de la restauration écologique côtière ainsi qu’à plusieurs études environnementales relatives à des infrastructures maritimes côtières et off-shore
34. "Les espèces marines de Mer Celtique et Golfe de Gascogne face aux changements climatiques"
35. Suivi par vidéo numérique de l’évolution du littoral
36. Etude de l’adhésion de l’huître creuse C. gigas au stade larvaire : localisation cellulaire de l’expression de gènes codant des protéines potentiellement adhésives.
37. Estimation des paramètres de la reproduction de la population de grands dauphins (Tursiops truncatus) du golfe normand-breton.
38. Estimation bayésienne de distributions d’abondances de proies sur la base de contenus stomacaux : approches par modélisation
39. Caractérisation des microplastiques dans la colonne d’eau et le tube digestif de petits pélagiques du Golfe du Lion au début de l’été : impact sur le régime alimentaire ?
40. Contamination de prédateurs supérieurs de l’Océan Indien par les Polluants Organiques Persistants

Sujets proposé aux étudiants de M2 BEM année 2015/16

1. Impact d’une contamination pétrolière sur les communautés microbiennes de sédiments de la mangrove guyanaise
2. Réponses adaptatives des populations phytoplanctoniques aux changements de l’écosystème côtier étudiées avec des souches de dinoflagellés germées à partir de sédiments anciens
3. La pompe biologique pendant la campagne DEWEX : apports des mesures de taille du plancton
4. Effet de la sélectivité de filets à plancton sur les spectres de taille du zooplancton, Impact sur les estimations d’abondance et de biomasse du zooplancton. Application aux échantillonnages des programmes MOOSE et ROMARIN
5. Etude des communautés microbiennes de subsurface du Massif Atlantis, dorsale Médio-Atlantique
6. Caractérisation d’un nouveau genre de bactéries thermo-¬‐acidophiles isolées de sources chaudes volcaniques
7. Processus associés au cycle de l’azote dans les sédiments de l’étang de Berre soumis à des épisodes d’hypoxie et structure des communautés microbiennes associées
8. Le métabolisme du fer chez la bactérie magnétotactique marine QH-2
9. Diversité intra et interspécifique au sein du genre Pseudo‐nitzschia : Croissance et synthèse d’acide domoïque en milieux contrôlés.
10. Impacts des marées vertes sur l’ichtyofaune des secteurs estuariens
11. Etude de l’effet d’une réserve de pêche sur la communauté de crustacés du Cap de Flamanville : Analyse de données de marquages et de séries temporelles de captures.
12. Estimation bayésienne de distributions d’abondances de proies sur la base de contenus stomacaux : approches par modélisation
13. Effets de perturbations sur la dynamique de deux modèles de réseaux trophiques
14. Cycle du silicium dans le Pacifique sud-ouest pendant la campagne OUTPACE : rôle des différents groupes planctoniques dans l’assimilation de silice biogénique
15. Mise au point d’une méthode d’analyse par reconnaissance d’images des fonds détritiques côtiers du Parc national de Port-Cros (Provence, France).
16. Importance des espèces biominéralisantes dans la composition de la matière en suspension et des agrégats au site PAP (Atlantique Nord)
17. Suivi d’intégrons environnementaux dans des sédiments contaminés
18. Modélisation de la dynamique des efflorescences d’Alexandrium minutum en compétition interspécifique. Impact de la diversité intraspécifique d’A. minutum sur la phénologie des blooms. Application à la rade de Brest
19. Adaptation au long terme des capacités physiologiques d’une cyanobactérie diazotrophe
20. Tracking nitrogen fluxes consequent to diazotrophy
21. Importance des espèces biominéralisantes dans la composition de la matière en suspension et des agrégats au site PAP (Atlantique Nord)
22. Dissolution des carbonates en mileiu tempéré dans un contexte de changemet global : le cas du maërl
23. Evaluation de l’âge et de la croissance de première année du chevaine (Cyprinidae, Squalius cephalus) par l’étude des otolithes.
24. Replenishing Tetiaroa’s lagoon through capture, culture and restocking of fish and crustacean post-larvae
25. Conchyliculture et ses conséquences sur le réseau microbien planctonique : Impact des mortalités de naissain d’huîtres dans la lagune de Thau
26. Phylogénie et détection d’espèces cryptiques chez les oursins Schizastéridés incubants antarctiques et subantarctiques
27. Réponse des communautés de poissons lacustres à des pressions multiples.
28. Cartographie du champ médian de contaminants chimiques à l’aide d’un modèle hydrodynamique. Application aux contaminants organiques hydrophiles sur la lagune de Thau
29. Building plankton genomic networks for deciphering the biological carbon pump in the global ocean
30. Diversité biologique en milieu artificiel : influence du type d’habitat par une approche DNA-barcoding
31. Optimisation des étapes de séquençage et de traitement des données
32. Etude de la connectivité chez Crepidula fornicata par utilisation d’empreintes élémentaires larvaires.
33. Analyse de la biodiversité intraspécifique au sein du complexe d’espèces du genre Dipturus.
34. Sélection de souches résistantes au chrome pour leurs utilisations en biorémédiation.
35. Evaluation des pressions anthropiques et de la qualité des eaux lagonaires dans la baie de Faaroa (Raiatea, Polynésie française)
36. Mesure de fragments de plastiques. Optimisation de la technique Zooscan et étude de la distribution en zone côtière Méditerranéenne.
37. Etude métagenomique des communautés microbiennes bathypélagiques
38. Structure de la communauté phytoplanctonique en Méditerranée Nord-occidentale en relation avec les caractéristiques hydrologiques : Campagne OSCAHR
39. Modélisation de la distribution de la crépidule sur les côtes de Manche-Atlantique
40. Quels Sentiers LIttoraux pour demain ? Analyse prospective et pluridisciplinaire de l’aménagement des sentiers côtiers en Méditerranée.
41. Analyse des facteurs impliqués dans la variation spatio-temporelle des mortalités des huîtres creuses, Crassostrea gigas
42. Efflorescences phytoplanctoniques en zone côtière : Croissance, broutage et état trophique des communautés microbiennes planctonique

Sujets proposés aux étudiants de M2 BEM année 2014/15
1. Isolement et caractérisation de souches bactériennes anaérobies d’environnements acides et leur implication dans la réduction de composés soufrés ou dans la spéciation de l’arsenic
2. Etude inter-populationnelle de l’impact du cadmium sur les mécanismes osmorégulateurs de Gammarus fossarum.
3. Etude de la colonisation de larves de coraux tropicaux par la microflore perforante à différents stades de développement
4. Détection et étude de virus géants par la mise en culture d’échantillons environnementaux en présence d’amibes des genres Acanthamoeba et Dictyostelium
5. Etude expérimentale de l’impact de la disponibilité en carbone et en fer pour les bactéries hétérotrophes à l’aide de mutants et bio-rapporteurs.
6. Bioremédiation par Holothuria scabra dans le contexte de la crevetticulture en Nouvelle-Calédonie
7. Experimental assessment of the sensitivity of marine nitrogen fixers to the phosphorus resource
8. Caractérisation de la perturbation de la reproduction suite à une exposition chronique à un mélange environnemental de PCB et de PBDE, conséquences sur les performances de la descendance.
9. Liens entre cheminement de la matière organique et les taux de contaminations métallique et organique au sein des réseaux trophiques des écosystèmes coralliens : une comparaison trans-Pacifique
10. Etude comparative de la diversité génétique entre deux espèces interfertiles, l’une indigène et l’autre non-indigènes, en situation de sympatrie : le cas de l’ascidie Ciona intestinalis spp.
11. EDGE : l’effet de la bordure d’un habitat à Zostera marina sur les communautés associées
12. Changement climatique et populations benthiques : approche bioénergétique (DEBCLIM)
13. Protein expression in diatoms, Morphological adaptation of diatoms, Zooplankton, Desalination, Microbial biofouling in desalination systems
14. Estimation bayésienne de distributions d’abondances de proies sur la base de contenus stomacaux : approches par modélisation
15. Analyse de la biodiversité des mammifères marins dans l’écosystème particulièrement riche des côtes de la Mauritanie et du Sénégal.
16. Implication fonctionnelle/physiologique de la voie paracellulaire dans la calcification du corail Stylophora pistilatta.
17. Etude de la mise en place d’épisodes d’anoxie sur les processus associés au cycle de l’azote – Etude en mésocosme
18. Etude expérimentale de la médiation chimique au sein des communautés benthiques de substrats durs
19. Réponse de Photobacterium phosphoreum ANT2200 aux changements maîtrisés des conditions de croissance
20. Les enzymes lipolytiques chez la microalgue marine Isochrysis galbana
21. Impact de la température sur les interactions Phytoplancton-Virus
22. écologie trophique et fonctionnelle des copépodes dans l’étang de Berre
23. Distributions en taille du plancton et des particules en relation avec le mélange vertical à deux stations côtières méditerranéennes.
24. Adaptation au long terme des capacités physiologiques d’une cyanobactérie diazotrophe
25. Amélioration de séries de Captures Par Unité d’Effort pour les flottilles ciblant les "gadidés" en Mer Celtique
26. Analyse de la variabilité spatiale et temporelle des rejets en Mer Celtique
27. Compétition interspécifique et efflorescences d’Alexandrium minutum en rade de Brest, Impact de la diversité du phytoplancton, de la germination et des conditions environnementales majeures
28. Estimation des paramètres d’un modèle DEB
29. facteurs contrôlant le développement d’une souche phytoplanctonique
30. Evaluation des peuplements de juvéniles de poissons et cartographie des nourriceries au sein des petits fonds rocheux de la côte Catalane (Espace Transfrontalier Catalan)
31. Prise en compte des connaissances des pêcheurs thoniers à la senne sur l’évolution de la capturabilité due à l’introduction des nouvelles technologies à bord dans les modèles Bayésiens de production excédentaire.
32. Evolution du recrutement du gastéropode invasif Crepidula fornicata en rade de Brest
33. Dynamique des communautés bactériennes de boues activées lors de leur enrichissement en populations Anammox
34. Analyse de la variabilité saisonnière et bisannuelle des ressources trophiques pélagique et benthique disponibles pour la faune benthique de l’archipel de Chausey
35. Évolution à long-terme de l’écosystème Sud Golfe de Gascogne en réponse aux forçages climatiques et anthropiques
36. Initiation des blooms phytplanctoniques : Etude de l’activité photosynthétique et de la production
37. Analyse comparative de l’impact sur les communautés marines pélagiques de la pêche sous dispositifs de Concentration de Poissons et de la pêche en bancs libres par les thoniers senneurs tropicaux
38. Utilisation d’empreintes élémentaires larvaires pour l’étude de la connectivité chez Crepidula fornicata
39. Estimation de l’état trophique, de la croissance et du broutage des communautés microbiennes planctoniques au cours d’efflorescences phytoplanctoniques dans la lagune de Thau
40. sujet 2014- 40.pdf Caractérisation des symbiontes bactériens au sein des stades de vie précoces des gastéropodes hydrothermaux Alvinoconcha spp
41. Etude de la sensibilité des communautés phytoplanctoniques lagonaires aux pressions de contamination chimique

Sujets proposé aux étudiants de M2 BEM année 2013/14
1. Caractérisation spatio-temporelle du potentiel reproducteur du bénitier T. maxima en Polynésie française
2. Etude des effets des rayonnements ionisants sur l’abeille
3. Spécificité des interactions microalgue-parasitoide
4. Evolution temporelles des populations de dinoflagellés suite aux phénomènes d’eutrophisation du milieu côtier
5. Structuration génétique péri-corse (marqueur microsatellite) du denti, sparidé marin côtier.
6. Etude des voies de contamination du bénitier Tridacna maxima par les toxines de type ciguatéra)

7. Diversité et activité des communautés microbiennes d’un écosystème hydrothermal alcalin, le site de Prony en Nouvelle Calédonie. Culture et isolement de nouvelles souches microbiennes
8. Potentiel d’hybridation entre espèces indigènes et non-indigènes d’un même complexe d’espèce :que peut nous apprendre une analyse moléculaire des stades juvéniles de Ciona intestinalis(Ascidiacea) ?
Importance du groupe des SAR202 appartenant au phylym des Chloroflexi dans le fonctionnement du domaine océanique profond
9. Caractérisation du bloom planctonique printanier dans la zone de convection profonde de Méditerranée Nord-occidentale-Campagne DEWEX :
10. Analyse de la variabilité spatiale et temporelle du transport de larves de soles dans le Golfe de Gascogne
11. Analyse des relations entre l’alimentation, les habitats et les contraintes morpho-anatomiques des mâchoires chez les poissons anguilliformes de Nouvelle-Calédonie
12. Etude de la distribution du phytoplancton en Manche occidentale par une approche automatisée et haute fréquence
13. Caractérisation d’intégrons environnementaux
14. Variations ontogéniques et saisonnières de la contamination métallique chez Scorpaena porcus (Poisson Téléostéen) dans les herbiers de posidonies.
15. Impact de nanoparticules métalliques sur les écosystèmes microbiens en microcosme
16. Effets in situ de facteurs environnementaux tels que l’acidification des océans et l’eutrophisation sur la microbioérosion récifale
17. Impact des efflorescences de dinoflagellés toxiques Alexandrium minutum et Karenia mikimotoi sur la coquille Saint Jacques Pecten maximus
18. sujet 2013- 19.docx Etude de la part de reproduction asexuée chez l’holothurie Stichopus
19. f Biogéochimie de la matière organique dissoute à l’interface océan-atmosphère : rôle des apports atmosphériques
20. Structure génétique des populations du bryozoaire Myriapora truncata, bioconstructeur et composante du coralligène, un écosystème typiquement méditerranéen. Inférences sur la
21. Rôle des lipides membranaires dans la sensibilité du phytoplancton aux composés allélopathiques produits par le dinoflagellé Alexandrium minutum
22. Modélisation de la réponse d’une communauté à une perturbation anthropique : approche écosystémique de la pêche
Analyse de la variabilité spatio-temporelle des captures et de l’effort de pêche en Mer Celtique
23. Analyse de la série temporelle zooplancton en Baie de Marseille et des paramètres environnementaux ( de SOMLIT et de SPECIMED (MERMEX) )
24. Modélisation bioénergétique des méduses (Pelagia noctiluca)
Etude de la diversité des peuplements coralliens en soutien à la création d’une AMP en milieu insulaire tropical
25. Interactions allélopathiques en milieu marin : caractérisation du pouvoir algicide des herbiers à Zostère sur le dinoflagellé neurotoxique Alexandrium catenella

26. Echange lagon /Océan des lagons chenaux en Nouvelle Calédonie importance des transferts trophiques entre le zooplancton et les téléostéens lagunaires
27. Interaction physique - biologie à micro-échelle : impact de la turbulence sur la croissance phytoplanctonique par une approche DEB
28. stage en bio-stat sur effort de pêche : C’est dans les vieux pots qu’on fait les meilleures soupes … de thons
29. Ecologie trophique de deux communautés intertidales à canopée d’algue brune : approche isotopique (δ13C vs δ15N) et fonctionnelle
30. Modélisation 0D des efflorescences d’Alexandrium en Penzé et en rade de Brets. Impact de la diversité du phytoplancton et des conditions environnementales
31. Caractérisation fonctionnelle des procaryotes associés au biofilm microphytobenthique des vasières intertidales des Pertuis Charentais
32. Osmodétection chez les téléostéens : approches cellulaires
33. phénologique des gorgones Paramuricea clavata et Eunicella cavolinii (Cnidaria, Octocorallia) : influence des changements environnementaux
34. Variabilité de l’abondance en particules et des communautés zooplanctoniques en Méditerranée Nord-Occidentale”
35. Etude des interactions entre la micro-algue toxique Alexandrium catenella et Vibrio splendidus LGP32, l’un des pathogènes de l’huître creuse Crassostrea giga